1959 metais Naujosios Vilnios rajonas buvo suskirstytas į 12 apylinkių. Apylinkės ir jų gyvenvietės 1959 m. vasario 1 d. duomenimis buvo aprašytos suskirstymo žinyno dviejose dalyse – I dalyje pagal administracinę priklausomybę (taip pat nurodant atstumą iki administracinio centro), II dalyje – pagal abėcėlę. Didžioji dauguma gyvenviečių buvo nurodytos kilmininko linksniu, mažuma (daugiausia miesto vietovės) – vardininko.
| Miestas | Miesto tipo gyvenvietė | Apylinkė | Centras | Atstumas iki rajono centro, km | Plotas, km² | Ūkiai |
|---|
| | Baniškių apylinkė | Galgiai | 6 | 53,7 | „Gegužės Pirmosios“ kolūkis |
| | Grigaičių apylinkė | Grigaičiai | 3 | 45,2 | Lenino vardo kolūkis, „Aušros“ kolūkis |
| | Kalvelių apylinkė | Kalveliai | 26 | 60,3 | „Lenino kelio“ kolūkis |
| | Kenos apylinkė | Lukšinė | 29 | 40,9 | „Draugystės“ kolūkis, A. Mickevičiaus vardo kolūkis |
| | Kirtimų apylinkė | Kirtimai | 31 | 45,3 | „Pergalės“ kolūkis |
| | Lavariškių apylinkė | Lavariškės | 19 | 86,7 | „Kelio į komunizmą“ kolūkis |
| | Medininkų apylinkė | Medininkai | 31 | 36,3 | „Jaunosios Gvardijos“ kolūkis, „Aušros“ kolūkis |
| | Mickūnų apylinkė | Mickūnai | 8 | 74,5 | Dzeržinskio vardo kolūkis, „Didvyrio“ kolūkis |
| | Rūkainių apylinkė | Rūkainiai | 23 | 30,6 | „Pergalės dienos“ kolūkis |
| | Senasalio apylinkė | Senasalis | 37 | 35,4 | „Kibirkšties“ kolūkis, „Raudonosios Vėliavos“ kolūkis, „Už tėvynę“ kolūkis |
| | Šumsko apylinkė | Šumskas | 32 | 56,24 | „Už taiką“ kolūkis, Šumsko tarybinis ūkis |
| | Žemaitėlių apylinkė | Žemaitėliai | 28 | 52,4 | Černiachovskio vardo kolūkis, „Naujo gyvenimo“ kolūkis |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Ažutilčių vk. | 3 | Ažutilčių vk. | Užtilčiai (Vilnius) |
| Kalabariškių km. | 2 | Kalabariškių km. | Kalabariškės |
| Kalvelių km. | 0 | Kalvelių km. | Kalveliai |
| Kenos gelež. st. | 0 | Kenos gelež. st. | Kenos GS |
| Kenos km. | 4 | Kenos km. | Kena |
| Kuosinės km. | 5 | Kuosinės km. | Kuosinė |
| Medetlų vk. | 9 | Medetlų vk. | Medetlos |
| Nemiežėlės km. | 5 | Nemiežėlės km. | Nemėžėlė (Kalveliai) |
| Pakenos gelež. st. | 6 | Pakenos gelež. st. | Pakenės GS |
| Pakenos km. | 4 | Pakenos km. | Pakenė |
| Palubėlių km. | 2 | Palubėlių km. | Palubėliai |
| Patakų vk. | 9 | Patakų vk. | Patakai |
| Ropėnų km. | 7 | Ropėnų km. | Ropėnai |
| Santakų km. | 5 | Santakų km. | Santakai (Vilnius) |
| Stauniškių km. | 3 | Stauniškių km. | Stauniškės |
| Špokinės vk. | 8 | Špokinės vk. | Špokinė |
| Tvankiškių I km. | 8 | Tvankiškių I km. | Tvankiškės (Kalveliai) |
| Tvankiškių II km. | 8 | Tvankiškių II km. | Tvankiškės II |
| Tvankiškių III km. | 8 | Tvankiškių III km. | Tvankiškės III |
| Žaliašilio km. | 1 | Žaliašilio km. | Žaliašilis (Kalveliai) |
| Žvėryno km. | 8 | Žveryno km. | Žvėrynas (Kalveliai) |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Arklėnų km. | 1,5 | Arklėnų km. | Arklėnai |
| Benediktiškių km. | 1,5 | Benediktiškių km. | Benediktiškės |
| Elžbietynės vk. | 2,5 | Elžbietynės vk. | Elžbietinė (Vilnius) |
| Juodiškių km. | 2,5 | Juodiškių km. | Juodiškės (Vilnius) |
| Jurčiukų vk. | 2,5 | Jurčiukų vk. | Jurčiukai (viensėdis) |
| Kenos km. | 1,5 | Kenos km. | Kena (Rukainiai) |
| Kisieliškių vk. | 1 | Kisieliškių vk. | Kisieliškės (Vilnius) |
| Lukšinės km. | 0 | Lukšinės km. | Lukšinė |
| Mantušių km. | 1,5 | Mantušių km. | Mantušiai |
| Naujasėdžių vk. | 1,5 | Naujasėdžių vk. | Naujasėdžiai (Rukainiai) |
| Pakalnių vk. | 1,5 | Pakalnių vk. | Pakalniai (Rukainiai) |
| Pavalkių km. | 1,5 | Pavalkių km. | Pavalkiai |
| Ramytės km. | 1,5 | Ramytės km. | Ramytė (Kena) |
| Tiltelių km. | 2,5 | Tiltelių km. | Tilteliai |
| Užukinės km. | 1,5 | Užukinės km. | Užukenė |
| Užuprūdžių km. | 0,5 | Užuprūdžių km. | Užuprūdžiai (Vilnius) |
| Vilkabariškių km. | 2,5 | Vilkabariškių km. | Varkalabiškės |
| Žebartonių km. | 2 | Žebartonių km. | Žybartonys |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Alfonsiškių vk. | 6 | Alfonsiškių vk. | Alponiškė |
| Avietinės vk. | 5 | Avietynės km. | Avietynė (Lavoriškės) |
| Baravykinės km. | 8 | Baravykinės km. | Baravykinė |
| Beržytės km. | 5 | Beržytės km. | Beržytė (Lavoriškės) |
| Bildžių km. | 6 | Bildžių km. | Bildžiai |
| Dekaniškių km. | 2 | Dekaniškių km. | Dekaniškės |
| Jurzdiko vk. | 1 | Jurzdiko vk. | Jurzdika (Vilnius) |
| Karoliškių km. | 3 | Karoliškių km. | Karoliškės |
| Kirtimų km. | 0 | Kirtimų km. | Kirtimai (Lavoriškės) |
| Lokinės vk. | 4 | Lokinės vk. | Lokinė (Vilnius) |
| Makovščiznos vk. | 6 | Makovščiznos vk. | Makovščizna |
| Medūniškių vk. | 6 | Medūniškių vk. | Mandutiškės |
| Mostiškių vk. | 3 | Mostiškių vk. | Mostiškės |
| Petrovščiznos km. | 7 | Petrovščiznos km. | Petrovščizna |
| Poniadalio vk. | 1 | Poniadalio vk. | Poniadalis |
| Puntūzų km. | 5 | Puntūzų km. | Puntuzai |
| Putinų km. | 2 | Putinų km. | Putinai (Vilnius) |
| Skynimų km. | 5 | Skynimų km. | Skynimai (Vilnius) |
| Šakališkių vk. | 5 | Šakališkių vk. | Šakališkės (Vilnius) |
| Vilkabrasčio vk. | 4 | Vilkabrasčio vk. | Vilkabrastis |
| Vitkiškių km. | 5 | Vitkiškių km. | Vitkiškės |
| Vyžiškių km. | 4 | Vyžiškių km. | Vyžiškės |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Adomaičių km. | 6 | Adomaičių km. | Adomaičiai |
| Beržininkų km. | 4 | Beržininkų km. | Beržininkai (Vilnius) |
| Budreliškių vk. | 2 | Budreliškių vk. | Budreliškės |
| Bukiškių km. | 1 | Bukiškių km. | Bukiškės (Lavoriškės) |
| Burniškių vk. | 2 | Burniškių vk. | Burniškės |
| Černuliškių km. | 3 | Černuliškių km. | Černuliškės |
| Fermos km. | 1 | Fermos km. | Ferma (Vilnius) |
| Galviškių km. | 2 | Galviškių km. | Galkiškės |
| Gražuliškių km. | 4 | Gražuliškių km. | Gražuliškės |
| Januliškių km. | 5 | Januliškių km. | Januliškės |
| Juozapinės vk. | 7 | Juozapinės vk. | Juozapinė (viensėdis) |
| Kaponiškių vk. | 5 | Kaponiškių vk. | Kaponiškės |
| Kazimieriškių vk. | 3 | Kazimieriškių vk. | Kazimieriškės (Vilnius) |
| Kuleliškių vk. | 3 | Kuleliškių vk. | Kuleliškės |
| Kuteliškių vk. | 2 | Kuteliškių vk. | Kuželiškės |
| Labiniškių km. | 3,5 | Labiniškių km. | Labaniškės |
| Lauryninkų vk. | 3 | Lauryninkų vk. | Lauryninkai |
| Lavariškių km. | 0 | Lavariškių km. | Lavoriškės |
| Liesiškių km. | 3 | Liesiškių km. | Liesiškės |
| Mačiuliškių km. | 3,5 | Mačiuliškių km. | Mačiuliškės (Lavoriškės) |
| Margų vk. | 7 | Margų vk. | Margiai (Vilnius) |
| Mažiulių km. | 3 | Mažiulių km. | Mažiuliai |
| Nevieriškių km. | 2 | Nevieriškių km. | Nevieriškės |
| Pabražuolės vk. | 7 | Pabražuolės vk. | Pabražuolė |
| Pauliukiškių km. | 2 | Pauliukiškių km. | Pauliukiškės |
| Pečiulinės vk. | 3 | Pečiulinės km. | Pečiulinė |
| Petruliškių km. | 4 | Petruliškių km. | Petruliškės |
| Pridotkų km. | 2 | Pridotkų km. | Pridotkai (Vilnius) |
| Pukštėnų vk. | 5 | Pukštėnų vk. | Pukštėnai |
| Santakos vk. | 7 | Santakos vk. | Santaka (Lavoriškės) |
| Saplidatiškių vk. | 1 | Saplidatiškių vk. | Saidotiškės |
| Sergiejevščiznos km. | 1 | Sergiejevščiznos km. | Pamiškiai |
| Slabados km. | 1 | Slabados km. | Slabada (Lavoriškės) |
| Sodybų km. | 2 | Sodybų km. | Sodybos (Vilnius) |
| Šakališkių vk. | 3 | Šakališkių vk. | Šalkiškės (Lavoriškės) |
| Šarkiškių vk. | 3,5 | Šarkiškių vk. | Šarkiškės (Lavoriškės) |
| Šniūrų vk. | 7 | Šniūrų vk. | Šniūrai (Vilnius) |
| Tvankiškių km. | 7 | Tvankiškių km. | Tvankiškės (Lavoriškės) |
| Uosininkų III km. | 2 | Uosininkų III km. | Uosininkai III (Lavoriškės) |
| Žaliašilio vk. | 7 | Žaliašilio vk. | Žaliašilis (Vilnius) |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Alaburdiškių km. | 3 | Alaburdiškių km. | Alaburdiškės (Vilnius) |
| Avietynės vk. | 1,5 | Avietynės vk. | Avietynė (Medininkai) |
| Bajorų vk. | 2,5 | Bajorų km. | Bajorai (Medininkai) |
| Beržytės vk. | 5 | Beržytės vk. | Beržytė (Medininkai) |
| Bikiškės vk. | 1 | Bikiškės vk. | Bikiškė |
| Dainavos km. | 6 | Dainavos km. | Dainava (Vilnius) |
| Dvarviečių km. | 2,5 | Dvarviečių km. | Dvarčiai (Vilnius) |
| Juozapinės km. | 1 | Juozapinės km. | Juozapinė (Medininkai) |
| Keipūnų km. | 1,5 | Keipūnų km. | Keipūnai |
| Kuosinės I vk. | 3 | Kuosinės I vk. | Kuosinė I |
| Kuosinės II vk. | 3 | Kuosinės II vk. | Kuosinė II |
| Kuosinės III km. | 3 | Kuosinės III km. | Kuosinė III |
| Kurganų (Pilkapių) km. | 1 | Kurganų (Pilkapių) km. | Pilkapiai (Medininkai) |
| Medininkų km. | 0 | Medininkų km. | Medininkai |
| Naujinės vk. | 4 | Naujinės km. | Naujinė (Vilnius) |
| Paalaburdiškių vk. | 3 | Paalaburdiškių vk. | Paalaburdiškės |
| Padvarionių km. | 2,5 | Padvarionių km. | Padvarionys (Vilnius) |
| Pagojaus vk. | 2 | Pagojaus vk. | Pagojis (Medininkai) |
| Rozdoljės (Tarpučių) km. | 5 | Rosdoljės (Tarpučių) km. | Tarpučiai (Medininkai) |
| Slabados km. | 3 | Slabados km. | Slabada (Medininkai) |
| Sudnikų vk. | 3 | Sudnikų vk. | Sūdninkai (Medininkai) |
| Šakiškių km. | 4,5 | Šakiškių km. | Šakiškės |
| Tereslaukio vk. | 1,5 | Tereslaukio vk. | Tereslaukis (Vilnius) |
| Varniškių km. | 6 | Varniškių km. | Varniškės (Medininkai) |
| Žinyno I dalis | Žinyno II dalis | Gyvenvietės straipsnis |
|---|
| Gyvenvietė | Atstumas, km | Gyvenvietė |
|---|
| Akmeninės vk. | 4,5 | Akmeninės vk. | Akmenė (Vilnius) |
| Andreliškių km. | 4 | Andreliškių km. | Andreliškės |
| Bruškiškių km. | 6 | Bruškiškių km. | Bruškiškės |
| Čepurniškių km. | 4 | Čepurniškių km. | Čepurniškės |
| Gudų km. | 2 | Gudų km. | Gudžiai (Vilnius) |
| Gulbinės km. | 1,5 | Gulbinės km. | Gulbinė (Vilnius) |
| Jurčiukų km. | 5,5 | Jurčiukų km. | Jurčiukai |
| Juškėnų km. | 6 | Juškėnų km. | Jukšėnai |
| Kaniūkiškių km. | 3 | Kaniūkiškių km. | Kaniūkiškės |
| Košeninkų km. | 5 | Košeninkų km. | Kalesninkai (Vilnius) |
| Kūlių km. | 5 | Kūlių km. | Kūliai |
| Lankelių km. | 3 | Lankelių km. | Lankeliai |
| Mūrininkų km. | 4,5 | Mūrininkų km. | Mūrininkai |
| Naujasėdžių km. | 2 | Naujasėdžių km. | Naujasėdžiai (Žemaitėliai) |
| Nelydiškių km. | 1 | Nelydiškių km. | Nelydiškės |
| Padvarniškių km. | 6 | Padvarniškių km. | Padvarninkai (Vilnius) |
| Pasvirės vk. | 17 | Oblizaukos (Pasvirės) vk. | Pasvirė |
| Pavaičio vk. | 5,5 | Pavaičio vk. | Pavaičys |
| Rūdinės vk. | 3 | Rūdinės vk. | Rūdynė (Vilnius) |
| Savičiūnų km. | 2,5 | Savičiūnų km. | Savičiūnai |
| Sirvydų km. | 4,5 | Sirvydų km. | Sirvydai |
| Svirčiukų km. | 3 | Svirčiukų km. | Svironys |
| Svogūnėlių vk. | 4 | Svogūnėlių vk. | Svogūnėliai |
| Šinkalaukio km. | 4 | Šinkalaukio km. | Šinkalaukis |
| Tribilų km. | 6 | Tribilų km. | Tribilai |
| Ulėnų km. | 6 | Ulėnų km. | Ulėnai |
| Žemaitėlių km. | 0 | Žemaitėlių km. | Žemaitėliai |
| Žemlių km. | 4 | Žemlių km. | Žemliai |