Azərbaycan
Deutschland
Lietuva
Malta
ශ්රී ලංකාව
Türkmenistan
Türkiyə
Украина
Deoksiribonukleorūgštis DNR nukleorūgštis esanti kiekvienoje eukariotinėje ląstelėje daugiausia jos branduolyje Joje jos
Deoksiribonukleorūgštis
Deoksiribonukleorūgštis (DNR) – nukleorūgštis, esanti kiekvienoje eukariotinėje ląstelėje, daugiausia jos branduolyje. Joje (jos azotinių bazių sekoje) yra tripletiniu kodu užkoduota genetinė informacija, kuri perduodama dalijimosi metu naujoms ląstelėms, o per lytines ląsteles – individo palikuonims.
Deoksiribonukleorūgštis susideda iš deoksiribonukleotidų. Deoksiribonukleotidas yra sudarytas iš heterociklinės azoto bazės ir angliavandenio deoksiribozės. Deoksinukleotidai skiriasi azoto bazėmis. Pagrindinės yra keturios: adeninas (A), guaninas (G), citozinas (C) ir timinas (T).
Deoksiribonukleotidai jungiasi į per fosforo rūgšties likutį tam tikru, kiekvienai individualiai deoksiribonukleorūgščiai specifiniu nuoseklumu. Deoksiribonukleorūgšties molekulė (išskyrus kai kurių virusų) susidaro iš 2 polinukleotidinių grandinių, susisukusių į spiralę apie bendrą ašį. Šias 2 grandines jungia vandenilinės jungtys, esančios tarp nukleotidų azoto bazių (pastarosios išsidėsčiusios spiralės viduje; jų plokštuma statmena spiralės ašiai). Adeninas (A) ir Timinas (T) jungiasi dviem vandeniliniais ryšiais, o Guaninas (G) ir Citozinas (C) trim vandeniliniais ryšiais.
DNR molekulė yra tokia plona, kad jos neįmanoma pamatyti net pro galingiausius optinius mikroskopus. DNR grandinė – tai dviguba spiralė, kuri yra panaši į susuktas virvines kopėčias su daugybe pakopų.
Kiekvienos organizmų rūšies DNR yra specifinė – turi skirtingą azotinių bazių kiekių santykį , arba specifiškumo koeficientą (įvairiuose organizmuose jis svyruoja nuo 0,32 iki 3,04), ir skirtingą bazių seką molekulėje. Būtent įvairuojanti bazių seka grandinėje ir nurodo gyvojo organizmo genetinį kodą, kuris nulemia organizmo ypatybes.
Interfazės metu lastelių ar bakterijų DNR dvigubėja remiantis komplementarumo principu. Dvigubėjant DNR iš pradžių nutrūksta vandeniliniai ryšiai tarp nukleotidų, DNR išsiskiria į dvi dalis, prie abiejų atsiradusių dalių nukleotidų (komplementarumo principu) ima jungtis nauji nukleotidai. Galiausiai visa grandinė tokiu būdu sudvigubėja.
Eukariotinėse (tikrabranduolėse ląstelėse) deoksiribunukleorūgšties galima rasti branduolyje, mitochondrijose, plastidėse.
Veikiama įvairių mutagenų, deoksiribonukleorūgšties struktūra kinta, dėl to dažnai organizme atsiranda mutacijų.
1944 išaiškinta deoksiribonukleorūgšties reikšmė paveldimumui. 1953 Dž. D. Votsonas (JAV) ir F. Krikas (Didžioji Britanija) atskleidė jos sandarą.
DNR išskyrimas
Žmogaus ir gyvūnų DNR molekuliniams genetiniams tyrimams galima išskirti iš:
- periferinio kraujo leukocitų; kraujo dėmių (Guthrie kortelės);
- choriono gaurelių;
- ;
- burnos epitelio ląstelių;
- parafininių biopsinių blokų;
- plauko su plauko folikulu; odos epitelio ląstelių; spermos (dažniausiai teismo medicinoje).
Nėra sunku išskirti ir augalų bei mikroorganizmų DNR, jei tik turima pakankamai pradinės medžiagos.
DNR yra santykinai chemiškai inertiška molekulė, kadangi aktyvios bazės yra invertuotos į dvigubos spiralės vidų ir apsaugotos inertišku fosfatų ir deoksiribozės karkasu, sujungtu fosfodiesterine jungtimi. Tačiau DNR molekulė nėra atspari fizinėms jėgoms, ypač šoninėms bei hidrodinaminėms. Tirpale dvispiralė DNR yra atsitiktinai susivyniojusi į kamuoliuką, kurį sustiprina vandenilinės jungtys tarp bazių ir elektrostatinis atstūmimas tarp neigiamai įkrautų fosfatinių grupių. Kuo ilgesnė DNR molekulė, tuo silpnesnės hidrodinaminės jėgos gali ją sufragmentuoti. Po standartinių DNR išskyrimo procedūrų dažniausiai gaunamos ~100-150 (200) kb ilgio DNR fragmentų mišinys. Jie tinka Sounthern’o analizei, PGR bei genominių bibliotekų kūrimui naudojant bakteriofagų vektorius. Fiziologinėmis sąlygomis dauguma DNR yra B formos (sukasi palei laikrodžio rodyklę, turi 10 bp (bazių porų) per vieną apsisukimą, apsisukimas lygus 3,4 nm).
Principas
Trys pagrindiniai DNR išskyrimo etapai:
- Ląstelių ir branduolio lipidinės membranos suardymas trinant, ultragarsu ar detergentais (SDS – Natrio dodecil/lauryl sulfatas); IGEPAL/NONIDET.
- Viduląstelinių ir histoninių baltymų pašalinimas pridėjus proteinazę K ir juos precipituojant pridėjus natrio ar amonio acetato, arba taikant fenolio-chloroformo-(izoamilo alkoholio) išskyrimo etapą (susidaro dvifazis tirpalas: DNR (ir kt. druskos) ištirpsta vandeninėje fazėje, o baltymai lieka organinėje fazėje; žingsniai kartojami; gali būti naudojamas tirpalas 25:24:1).
- DNR precipitacija paveikus šaltu 96º etanoliu ar izopropanoliu (izopropilo alkoholiu) (DNR netirpsta alkoholyje ir iškrenta į nuosėdas; taip pat yra pašalinamos druskos)
- Vėliau DNR kelis kartus perplaunama alkoholiu (70, 96º etanoliu) džiovinama ir užpilama TE buferiu (šarminis buferis) arba laikoma -20 ištirpinta etanolyje (DNR bankas).
Iš 20 ml veninio kraujo išsiskiria apie 250 µg DNR (branduolinė + mitochondrinė).
Šaltiniai
- Juodka Benediktas (1989). Nukleino rūgščių, chemijos ir biochemijos pagrindai. Vilnius, „Mokslas“, 1989, 271p.
Nuorodos
- DNR anatomijos animacija (liet.) Archyvuota kopija 2008-01-18 iš Wayback Machine projekto.
- Chromosomos struktūros animacija (liet.) Archyvuota kopija 2008-01-18 iš Wayback Machine projekto.
Autorius: www.NiNa.Az
Išleidimo data:
vikipedija, wiki, lietuvos, knyga, knygos, biblioteka, straipsnis, skaityti, atsisiųsti, nemokamai atsisiųsti, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, pictu, mobilusis, porn, telefonas, android, iOS, apple, mobile telefl, samsung, iPhone, xiomi, xiaomi, redmi, pornografija, honor, oppo, Nokia, Sonya, mi, pc, web, kompiuteris, Informacija apie Deoksiribonukleorūgštis, Kas yra Deoksiribonukleorūgštis? Ką reiškia Deoksiribonukleorūgštis?
Deoksiribonukleorugstis DNR nukleorugstis esanti kiekvienoje eukariotineje lasteleje daugiausia jos branduolyje Joje jos azotiniu baziu sekoje yra tripletiniu kodu uzkoduota genetine informacija kuri perduodama dalijimosi metu naujoms lastelems o per lytines lasteles individo palikuonims DNR fragmento erdvinis modelisBesidalinantis DNR fragmentas Deoksiribonukleorugstis susideda is deoksiribonukleotidu Deoksiribonukleotidas yra sudarytas is heterociklines azoto bazes ir angliavandenio deoksiribozes Deoksinukleotidai skiriasi azoto bazemis Pagrindines yra keturios adeninas A guaninas G citozinas C ir timinas T Deoksiribonukleotidai jungiasi į per fosforo rugsties likutį tam tikru kiekvienai individualiai deoksiribonukleorugsciai specifiniu nuoseklumu Deoksiribonukleorugsties molekule isskyrus kai kuriu virusu susidaro is 2 polinukleotidiniu grandiniu susisukusiu į spirale apie bendra asį Sias 2 grandines jungia vandenilines jungtys esancios tarp nukleotidu azoto baziu pastarosios issidesciusios spirales viduje ju plokstuma statmena spirales asiai Adeninas A ir Timinas T jungiasi dviem vandeniliniais rysiais o Guaninas G ir Citozinas C trim vandeniliniais rysiais DNR molekule yra tokia plona kad jos neįmanoma pamatyti net pro galingiausius optinius mikroskopus DNR grandine tai dviguba spirale kuri yra panasi į susuktas virvines kopecias su daugybe pakopu Kiekvienos organizmu rusies DNR yra specifine turi skirtinga azotiniu baziu kiekiu santykį A TG C displaystyle A T over G C arba specifiskumo koeficienta įvairiuose organizmuose jis svyruoja nuo 0 32 iki 3 04 ir skirtinga baziu seka molekuleje Butent įvairuojanti baziu seka grandineje ir nurodo gyvojo organizmo genetinį koda kuris nulemia organizmo ypatybes DNR nukleotidu jungtys Interfazes metu lasteliu ar bakteriju DNR dvigubeja remiantis komplementarumo principu Dvigubejant DNR is pradziu nutruksta vandeniliniai rysiai tarp nukleotidu DNR issiskiria į dvi dalis prie abieju atsiradusiu daliu nukleotidu komplementarumo principu ima jungtis nauji nukleotidai Galiausiai visa grandine tokiu budu sudvigubeja Eukariotinese tikrabranduolese lastelese deoksiribunukleorugsties galima rasti branduolyje mitochondrijose plastidese Veikiama įvairiu mutagenu deoksiribonukleorugsties struktura kinta del to daznai organizme atsiranda mutaciju 1944 isaiskinta deoksiribonukleorugsties reiksme paveldimumui 1953 Dz D Votsonas JAV ir F Krikas Didzioji Britanija atskleide jos sandara DNR isskyrimasZmogaus ir gyvunu DNR molekuliniams genetiniams tyrimams galima isskirti is periferinio kraujo leukocitu kraujo demiu Guthrie korteles choriono gaureliu burnos epitelio lasteliu parafininiu biopsiniu bloku plauko su plauko folikulu odos epitelio lasteliu spermos dazniausiai teismo medicinoje Nera sunku isskirti ir augalu bei mikroorganizmu DNR jei tik turima pakankamai pradines medziagos DNR yra santykinai chemiskai inertiska molekule kadangi aktyvios bazes yra invertuotos į dvigubos spirales vidu ir apsaugotos inertisku fosfatu ir deoksiribozes karkasu sujungtu fosfodiesterine jungtimi Taciau DNR molekule nera atspari fizinems jegoms ypac soninems bei hidrodinaminems Tirpale dvispirale DNR yra atsitiktinai susivyniojusi į kamuoliuka kurį sustiprina vandenilines jungtys tarp baziu ir elektrostatinis atstumimas tarp neigiamai įkrautu fosfatiniu grupiu Kuo ilgesne DNR molekule tuo silpnesnes hidrodinamines jegos gali ja sufragmentuoti Po standartiniu DNR isskyrimo proceduru dazniausiai gaunamos 100 150 200 kb ilgio DNR fragmentu misinys Jie tinka Sounthern o analizei PGR bei genominiu biblioteku kurimui naudojant bakteriofagu vektorius Fiziologinemis salygomis dauguma DNR yra B formos sukasi palei laikrodzio rodykle turi 10 bp baziu poru per viena apsisukima apsisukimas lygus 3 4 nm Principas Trys pagrindiniai DNR isskyrimo etapai Lasteliu ir branduolio lipidines membranos suardymas trinant ultragarsu ar detergentais SDS Natrio dodecil lauryl sulfatas IGEPAL NONIDET Vidulasteliniu ir histoniniu baltymu pasalinimas pridejus proteinaze K ir juos precipituojant pridejus natrio ar amonio acetato arba taikant fenolio chloroformo izoamilo alkoholio isskyrimo etapa susidaro dvifazis tirpalas DNR ir kt druskos istirpsta vandenineje fazeje o baltymai lieka organineje fazeje zingsniai kartojami gali buti naudojamas tirpalas 25 24 1 DNR precipitacija paveikus saltu 96º etanoliu ar izopropanoliu izopropilo alkoholiu DNR netirpsta alkoholyje ir iskrenta į nuosedas taip pat yra pasalinamos druskos Veliau DNR kelis kartus perplaunama alkoholiu 70 96º etanoliu dziovinama ir uzpilama TE buferiu sarminis buferis arba laikoma 20 istirpinta etanolyje DNR bankas Is 20 ml veninio kraujo issiskiria apie 250 µg DNR branduoline mitochondrine SaltiniaiJuodka Benediktas 1989 Nukleino rugsciu chemijos ir biochemijos pagrindai Vilnius Mokslas 1989 271p NuorodosVikiteka Deoksiribonukleorugstis vaizdine ir garsine medziagaVikizodynas Laisvajame zodyne yra terminas deoksiribonukleorugstis DNR anatomijos animacija liet Archyvuota kopija 2008 01 18 is Wayback Machine projekto Chromosomos strukturos animacija liet Archyvuota kopija 2008 01 18 is Wayback Machine projekto